Bábok:
Működtetésükhöz Csakrára van szükség. A bábmester szálakon mozgatja a bábot, amit igen erős fegyvernek lehet hazsnálni. Ilyen hazsnáló Kankuro, Sasori és Chiyo.
Botok:
Védekezésre kiválóak. A Harmadik Hokage is ezt használta, mikor Orochimaru ellen harcolt.
Boxer:
Sarutobi Asuma használja ezeket a fegyvereket. A ninja a kezén hordja ezt a fegyvert. Támadások blokkolására kiválóak.
Flaska:
A flaskák általában víz szállítására vannak, de Gaara bebizonyította, hogy homok is szállítható benne. Ebben a flaskában hordja Gaara magával a homokot, ami meg van töltve Chakrával.
Füst gránát:
Sima füst gránátok, amik az ellenfél elterelésére szolgálnak, vagy éppen menekülésre.
Hang csövek:
A használó, Zaku kezébe be van építve, hogy egy akár egy kis adag Chakra felhasználásával erős hanghullámot lökjön ki az ellenfél irányában.
Harangok:
Ezek nem is igazán fegyvereknek mondható, de Kin egyfajta Genjutsu-hoz használja.
Kard:
Néhány ninja speciális, vagy rövid kardot használ. Ennek a fegyvernek is van külön technikája. Ilyen fegyver használó Zabuza is.
Kunai:
Az egyik legtöbbször használt fegyver. El lehet dobni, mint a Shiruken-t, és közelharcban is sokszor alkalmazzák. A Kunai sok minden másra aklamas még.
Legyező:
Megsemmisítő erővel bírő legyező, amit Chakrával töltenek fel folyamatosan, így iszonyatosan erős széltámadásokat lehet létrehozni. A jó használathoz nagy eőre és sok Chakrára van szükség.
Mérgezett nyilak:
Ezeket főleg orvosi ninják használják, illetve az olyanok, akik ölni akarnak. Eddig csak két emberről tudjuk, hogy használta valaha is, Haku és Shizune.
Robbanó cédulák:
A Kunai késekre szokták erősíteni, és egy idő után felrobban , így szokták ezt általában használni.
Same Hade:
Ezt a kardot Hoshigake Kisame használja. Kívül tüskés és el tudja szívni az ellenfél Chakráját.
Sarlók és láncok:
Két ember használja ezt, a Démon testvérek. Ez amolyan távolsági fegyver. Nagyon erősek, az ellenféllel másodpercek alatt képes végezni.
Shuriken:
Eldobva sebzi meg az ellenfelet. A nagyobb Shuriken sebezni, míg a kisebbel akár ölni is lehet. Minden ninja magánál hord pár kisebb darabot, de nagyobbakat nem igazán használnak.
Tekercsek:
Több formában léteznek. Idézésre és gyógyításra is használják őket.
Tű (Senbon):
Ezeket a fegyvereket főleg az orvosi ninják használják, akupunkúrákhoz, de később a ninják fegyverei között is megtalálhatóak, a ninja vadászok vették át a tűket. Az ellenfél megölésére vagy lebénítására használják.